马磊，男，1979年6月出生，博士（后），教授，博士生导师，石河子大学学科带头人，现从事生物信息学与遗传资源方面的研究。近年主持国家自然科学基金（面上项目1项、地区基金3项）、国家高技术研究发展计划（863）子课题、中国博士后科学基金（面上一等资助、特别资助）、人社部留学人员科技活动择优资助等项目，获农业农村部神农中华农业科技奖一等奖、农业部中华农业科技奖创新团队奖、中国农业科学院优秀博士后奖、全国大学生生命科学竞赛一等、二等、三等及优胜奖（指导教师）、石河子大学优秀青年教师、优秀硕士学位论文指导教师等奖项。
1. 学习和工作经历
2005年至今，石河子大学生命科学学院，讲师、副教授、教授；
2022年－2023年，新西兰奥塔哥大学，访问教授；
2013年－2014年，新西兰奥塔哥大学，博士后；
2011年－2013年，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，博士后；
2007年－2010年，西北农林科技大学，生物信息学专业，博士学位；
2002年－2005年，西北农林科技大学，动物遗传育种与繁殖专业，硕士学位。
2. 招生专业与开设课程
博士招生专业：生物学（生物信息学、遗传学、微生物学等方向）
硕士招生专业：
（1）学术学位：生物学（生物信息学、遗传学、微生物学等方向）；
（2）专业学位：生物与医药（生物工程）、学科教育（生物）。
承担本科生《遗传学》、《生物统计学》、《生物信息学》、《PERL编程》、硕士生《生物信息学算法导论》、《分子进化与系统发育》、博士生《生物信息与数据处理》等课程。
3. 主要研究方向
生物信息学方向：利用数学、统计学和信息科学的方法，探索基因组进化、基因表达调控、基因互作网络、代谢网络等方面的理论和算法。
遗传资源方向：应用生物信息学技术，搜寻、分析和可视化特殊生境中抗旱、抗冻、耐盐碱、固沙等方面的分子遗传特质和生态效应。
微生物学方向：利用代谢组、宏基因组技术，探究宿主与微生物之间的互作通路。
4. 主持的科研项目
国家自然科学基金（地区基金）：羽毛针禾对其根鞘核心微生物组的遗传塑造作用及调控机制，编号：32060145，2021/01 - 2024/12，在研，主持。
国家自然科学基金（地区基金）：应用CPR改进基因共表达网络探究反式剪接的调控因子及机制，编号：31860308，2019/01 - 2022/12，结题，主持。
国家自然科学基金（地区基金）：基于GBS-RNA-seq整合组学解析羽毛针禾基因组变异与沙生适应性的关系，编号：31560310，2016/01-2019/12，结题，主持。
国家自然科学基金（面上项目）：基于猪生殖系统研究嵌合RNA的形成新机制及其繁殖调控功能，编号：31272416，2013/01 - 2016/12，结题，主持。
国家高技术研究发展计划（863）子课题：猪经济性状的功能基因组学研究，编号：2013AA102502，2013/01 - 2017/12，结题，主持。
人力资源和社会保障部留学人员科技活动择优资助项目（启动类）：基于GBS-SNPs技术研究固沙植物羽毛针禾基因流动态及沙生适应性，编号：人社厅函[2015]192号2015LX004，2016/01 - 2018/06，结题，主持。
中国博士后科学基金（特别资助）：结合五指山猪基因组探讨嵌合RNA的形成新机制及其功能，编号：2012T50166，2013/01 - 2014/12，结题，主持。
中国博士后科学基金（面上一等资助）：基于高通量组学数据研究猪microRNA靶向调控网络及功能，编号：20110490045，2012/01 - 2014/12，结题，主持。
石河子大学高层次人才科研启动专项（博士类）：绵羊融合RNA与其亲本基因的鉴定、功能及在毛囊组织中的表达规律研究，编号：RCZX201137，2012/01 - 2014/12，结题，主持。
石河子大学高层次人才科研启动专项（硕士类）：家禽细胞趋化因子MCP-1克隆及表达研究，编号：RCZX200523，2006/01 - 2007/12，结题，主持。
5. 代表性科研成果
代表性论文:
Yong Chen#, Ting Ma#, Tingting Zhang*, Lei Ma*. Trends in the evolution of intronless genes in Poaceae. Frontiers in Plant Science. 2023, 14:1065631.
Zhijun Zhang, Tingting Zhang*, Lei Ma*. Analysis of basic pentacysteine6 transcription factor involved in abiotic stress response in Arabidopsis thaliana. Frontiers in Genetics, 2023, 14: 1097381.
Wenkang Niu, Tingting Zhang*, Lei Ma*. Correlation analysis between immune-related genes and cell infiltration revealed prostate cancer immunotherapy biomarkers linked to T cells gamma delta. Scientific Reports. 2023, 13(1): 2459.
Piaopiao Li, Xuemei Kuang, Tingting Zhang*, Lei Ma*. Shared network pattern of lung squamous carcinoma and adenocarcinoma illuminates therapeutic targets for non-small cell lung cancer. Frontiers in Surgery. 2022, 9:958479.
Piaopiao Li, Hui Yuan, Xuemei Kuang, Tingtin Zhang, Lei Ma*. Network module function enrichment analysis of lung squamous cell carcinoma and lung adenocarcinoma. Medicine. 2022, 101(47): e31798.
Xixu Ding, Tingting Zhang*, Lei Ma*. Rapidly evolving genetic features for desert adaptations in Stipagrostis pennata. BMC Genomics. 2021, 22(1): 846.
Piaopiao Li, Yingxia Li, Lei Ma*. Potential role of chimeric genes in pathway-related gene co-expression modules. World Journal of Surgical Oncology. 2021, 19(1): 149.
Tingting Zhang, Feng Hu*, Lei Ma*. Phosphate-solubilizing bacteria from safflower rhizosphere and their effect on seedling growth. Open Life Sciences. 2019, 14(1): 246-254.
Kai Wei, Lei Ma*, Tingting Zhang*. Characterization of gene promoters in pig: Conservative elements, regulatory motifs and evolutionary trend. PeerJ. 2019, 7: e7204.
Kai Wei#, Tingting Zhang#, Lei Ma*. Divergent and convergent evolution of housekeeping genes in human-pig lineage. PeerJ. 2018, 6:e4840.
Lei Ma, Shulin Yang, Weiming Zhao, Zhonglin Tang, Tingting Zhang, Kui Li*. Identification and analysis of pig chimeric mRNAs using RNA sequencing data. BMC Genomics. 2012, 13(1):429.
Lei Ma, Tingting Zhang, Zhuoran Huang, Xiaoqian Jiang, Shiheng Tao*. Patterns of nucleotides that flank substitutions in human orthologous genes. BMC Genomics. 2010, 11(1):416.
专著:
马磊，张婷婷（著），《嵌合基因——生物分子网络的桥梁》，九州出版社，北京，2016，ISBN：9787510846878.
软件著作权:
马磊，张婷婷. GBS-RNA-seq 整合组学分析软件，2017，计算机软件著作权，中国，登记号：2017SR351033.
马磊，张婷婷. Chimeric Gene转录丰度量化软件，2016，计算机软件著作权，中国，登记号：2016SR154264.
马磊，张婷婷. 嵌合基因网络效应解析软件, 2016，计算机软件著作权，中国，登记号：2016SR378638.
张婷婷，马磊. 嵌合基因结构域解析软件，2016，计算机软件著作权，中国，登记号：2016SR379095.
马磊，张婷婷. Chimeric RNA 鉴定软件，2014，计算机软件著作权，中国，登记号：2014SR216881.
6. 获奖情况
农业农村部2022-2023年度神农中华农业科技奖科学研究类成果一等奖：猪分子育种技术体系创建与应用
农业部2015年度中华农业科技奖优秀创新团队类成果奖
中国农业科学院2012年度优秀博士后奖
全国大学生生命科学竞赛一等、二等、三等和优胜奖（指导教师）
石河子大学2018年度优秀青年教师
石河子大学2017年度实践教学先进个人
石河子大学2015年度优秀教案设计奖
石河子大学2016年度教学成果二等奖
石河子大学2010年度教学成果三等奖
石河子大学2021、2022、2023年度优秀硕士学位论文（指导教师）
7. 毕业的研究生
目前指导12名硕士生毕业，其中2名在国外、2名在国内攻读博士学位，8名就业；指导1名博士生毕业，现在国内高校任教。
8. 联系方式
电子邮箱：malei1979@hotmail.com
