马磊，男，1979年6月出生，博士（后），教授，博士生导师，入选省级人才项目、石河子大学“3152”高层次青年骨干人才及学科带头人计划。主要从事生物信息学、遗传资源挖掘、微生物互作方向研究。近年主持国家自然科学基金（面上项目1 项、地区基金 3 项）、国家高技术研究发展计划（863 计划）子课题、中国博士后科学基金（面上一等资助 1 项、特别资助 1 项）、人社部留学人员科技活动择优资助等项目。获农业农村部神农中华农业科技奖一等奖及创新团队奖、中国农业科学院优秀博士后奖、石河子大学优秀青年教师、实践教学先进个人、优秀教案设计奖、优秀课程质量奖，以及教学成果一、二、三等奖。指导学生获全国大学生生命科学竞赛一、二、三等奖及优胜奖，获评优秀指导教师；指导研究生获石河子大学优秀硕士学位论文。受聘担任国家自然科学基金、浙江省自然科学基金、河南省自然科学基金、教育部学位中心、学术桥函评专家。

1. 学习和工作经历

2005年至今，石河子大学生命科学学院，讲师、副教授、教授；

2022年－2023年，新西兰奥塔哥大学，访问教授；

2013年－2014年，新西兰奥塔哥大学，博士后；

2011年－2013年，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，博士后；

2007年－2010年，西北农林科技大学，生物信息学专业，博士；

2002年－2005年，西北农林科技大学，动物遗传育种与繁殖专业，硕士。

1998年－2002年，西北民族大学，动物科学专业，学士。

2. 招生专业与开设课程

（1）招生专业

博士：生物学

硕士：学硕——生物学；专硕——生物与医药（生物工程）

（2）开设课程：先后为本科生、研究生讲授遗传学、生物统计学、生物信息学、Perl 编程、分子进化与系统发育、生物信息学算法导论等课程。

3. 主要研究方向

生物信息学方向：融合数学、统计学与信息科学方法，开发算法，解析基因组进化、基因表达调控、基因互作网络及代谢网络的内在机制。

遗传资源方向：面向干旱、盐碱等特殊生境，依托生物信息学技术发掘植物抗旱、抗冻、耐盐碱、固沙相关分子遗传特征，并阐释其生态效应。

微生物学方向：利用宏基因组学、代谢组学技术，解析宿主—微生物互作通路及其功能机制。

4. 主持的科研项目

国家自然科学基金（面上项目）：基于猪生殖系统研究嵌合RNA的形成新机制及其繁殖调控功能。

国家自然科学基金（地区基金）：羽毛针禾对其根鞘核心微生物组的遗传塑造作用及调控机制。

国家自然科学基金（地区基金）：应用CPR改进基因共表达网络探究反式剪接的调控因子及机制。

国家自然科学基金（地区基金）：基于GBS-RNA-seq整合组学解析羽毛针禾基因组变异与沙生适应性的关系。

国家高技术研究发展计划（863计划）子课题：猪经济性状的功能基因组学研究。

人力资源和社会保障部留学人员科技活动择优资助项目：基于GBS-SNPs技术研究固沙植物羽毛针禾基因流动态及沙生适应性。

中国博士后科学基金（特别资助）：结合五指山猪基因组探讨嵌合RNA的形成新机制及其功能。

中国博士后科学基金（面上一等资助）：基于高通量组学数据研究猪microRNA靶向调控网络及功能。

石河子大学高层次人才科研启动专项（博士类）：绵羊融合RNA与其亲本基因的鉴定、功能及在毛囊组织中的表达规律研究。

石河子大学高层次人才科研启动专项（硕士类）：家禽细胞趋化因子MCP-1克隆及表达研究。

5. 代表性科研成果

（1）代表性论文

Zeng X, Li P, Li L, Zhao Y, Luo X, Zhang T, Ma L*. Release of multilayered constraints drives metabolic and regulatory evolutionary strategies for polyethylene biodegradation. Journal of Cleaner Production, 2026, 576: 149244.

Liu W, Lu L, Zeng X, Zhang T*, Ma L*. Microbial synergism in a synthetic consortium enabled efficient polyethylene biodegradation. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2026, 316: 120151.

Zeng X, Li P, Zhao Y, Zheng W, Zhang T*, Ma L*. Synergistic UV and acridine orange mutagenesis enhances polyethylene biodegradation by Sphingobacterium prati BS2. Frontiers in Microbiology. 2026, 17:1730975.

Yuan Y, Pang S, Niu W, Zhang T*, Ma L*. Community structure, growth-promoting potential, and genomic analysis of seed-endophytic bacteria in Stipagrostis pennata. Microorganisms, 2025, 13(8): 1754.

Yin T, Zhang T*, Ma L*. Immune-related hub genes and their role in psoriasis pathogenesis. Scientific Reports, 2025, 15(1): 17765.

Niu W, Zhang T*, Ma L*. Competitive endogenous RNA network involving immune subgroups, infiltration, and lncRNAs in prostate cancer. Genes, 2025, 16(5): 527.

Kong L, Zhang T*, Ma L*. The impact of retrotransposons on castor bean genomes. Frontiers in Plant Science. 2024, 15:1397215.

Niu W, Li G, Zhang T*, Ma L*. Prostate cancer subtyping and differential methylation analysis based on the ETS family of transcription factors fusion genes. Scientific Reports, 2024, 14(1): 20782.

Chen Y^#, Ma T^#, Zhang T*, Ma L*. Trends in the evolution of intronless genes in Poaceae. Frontiers in Plant Science. 2023, 14:1065631.

Zhang Z, Zhang T*, Ma L*. Analysis of basic pentacysteine6 transcription factor involved in abiotic stress response in Arabidopsis thaliana. Frontiers in Genetics, 2023, 14: 1097381.

Niu W, Zhang T*, Ma L*. Correlation analysis between immune-related genes and cell infiltration revealed prostate cancer immunotherapy biomarkers linked to T cells gamma delta. Scientific Reports. 2023, 13(1): 2459.

Li P, Kuang X, Zhang T*, Ma L*. Shared network pattern of lung squamous carcinoma and adenocarcinoma illuminates therapeutic targets for non-small cell lung cancer. Frontiers in Surgery. 2022, 9:958479.

Li P, Yuan H, Kuang X, Zhang T, Ma L*. Network module function enrichment analysis of lung squamous cell carcinoma and lung adenocarcinoma. Medicine. 2022, 101(47): e31798.

Ding X, Zhang T*, Ma L*. Rapidly evolving genetic features for desert adaptations in Stipagrostis pennata. BMC Genomics. 2021, 22(1): 846.

Li P, Li Y, Ma L*. Potential role of chimeric genes in pathway-related gene co-expression modules. World Journal of Surgical Oncology. 2021, 19(1): 149.

Zhang T, Hu F*, Ma L*. Phosphate-solubilizing bacteria from safflower rhizosphere and their effect on seedling growth. Open Life Sciences. 2019, 14(1): 246-254.

Wei K, Ma L*, Zhang T*. Characterization of gene promoters in pig: Conservative elements, regulatory motifs and evolutionary trend. PeerJ. 2019, 7: e7204.

Wei K^#, Zhang T^#, Ma L*. Divergent and convergent evolution of housekeeping genes in human-pig lineage. PeerJ. 2018, 6:e4840.

Ma L, Yang S, Zhao W, Tang Z, Zhang T, Li K*. Identification and analysis of pig chimeric mRNAs using RNA sequencing data. BMC Genomics. 2012, 13(1):429.

Ma L, Zhang T, Huang Z, Jiang X, Tao S*. Patterns of nucleotides that flank substitutions in human orthologous genes. BMC Genomics. 2010, 11(1):416.

（2）专著及教材

著《嵌合基因——生物分子网络的桥梁》，九州出版社，2016.

编《生物信息学》（第十章代谢组学），科学出版社，2024.

（3）软件著作权

GBS-RNA-seq 整合组学分析软件，2017.

Chimeric Gene转录丰度量化软件，2016.

嵌合基因网络效应解析软件，2016.

Chimeric RNA 鉴定软件，2014.

嵌合基因结构域解析软件，2016.

（4）专利

一种用于降解聚乙烯地膜的微生物菌株组合、微生物制剂、降解聚乙烯地膜的方法及应用。

一种降解聚乙烯地膜的粘着剑菌菌株、微生物制剂、方法以及应用。

6. 获奖情况

农业农村部2022–2023 年度神农中华农业科技奖科学研究类成果一等奖：猪分子育种技术体系创建与应用

农业部2015 年度中华农业科技奖优秀创新团队奖：猪基因工程与种质创新团队

中国农业科学院2012 年度优秀博士后奖

全国大学生生命科学竞赛一、二、三等奖及优胜奖（指导教师）

石河子大学2023 年度教学成果一等奖

石河子大学2021、2022、2023 年度优秀硕士学位论文（指导教师）

石河子大学2018 年度优秀青年教师

石河子大学2017 年度实践教学先进个人

石河子大学2016 年度教学成果二等奖

石河子大学2015 年度优秀教案设计奖

石河子大学2010 年度教学成果三等奖

7. 毕业研究生：所指导毕业生就职于国内高校、事业、企业等单位。

8. 联系方式：malei1979@hotmail.com